Scrat, kaza ile kıtaları sallayan büyük bir felaketi tetiklediğinde, Manny, Ellie ve Peaches’ten ayrılmak zorunda kaldı. Diego, Sid ve Granny ile birlikte buzdağının üstünde mahsur kaldılar. Ancak Manny, ailesine dönmek için kararlıydı ve bu konuda söz vermişti. Okyanusu aşmaya başladıklarında, denizlerin tehlikeli korsanlarından oluşan Kaptan Gutt ve onun çetesi tarafından esir alındılar. Ancak kaçmayı başardılar ve Manny, Kaptan Gutt’ın gemisini ele geçirip denizde tehlikeli bir yolculukla vatanlarına geri dönmek için bir plan yapmaya başladı. Ancak zalim korsanlar, Manny, ailesi ve arkadaşlarına karşı intikam yemini etmişlerdi.