Bir zamanlar korkunç bir ork olan Shrek, şimdi karısı Fiona ve üç çocuğuyla iyi bir yaşam sürdürmektedir. Ancak çocuklarının doğum günü partisinde ve arkadaşlarıyla birlikte ani bir çöküş yaşar. Birden Fiona ile tanışmadan önce olduğu gibi gerçek bir ork olmak istemeye başlar. Bu yüzden hilekar anlaşmacı Rumpelstiltskin’den yardım ister. İlk başta Shrek, kaybettiği yaşamı yeniden yaşar ve her şey yolundadır gibi görünür. Ancak Rumpelstiltskin tarafından tuzak kurulduğunu kısa süre sonra fark eder. Artık ülkeyi demir yumrukla yöneten Rumpelstiltskin’in karşısına geçmek için arkadaşları Eşek, Fiona ve Puss in Boots ile birlikte Shrek, hayatını geri almaya çalışırken hayatının savaşını vermek zorundadır, çünkü zaman tükenmek üzeredir.